Термоклей для термоклеевых пистолетов отличается не только по цвету, но и по составу. Каждый стержень склеивает лучше свои поверхности (под которые он заточен)
То есть цвет, в данном случае, - это маркировка стержней.
Прозрачные стержни считаются универсальными:
непрозрачные цветные стержни - тоже универсальные, но с красителем (для подбора под цвет материала)
белые стержни - стекло и металл (но может быть вариантом непрозрачного универсала с белым красителем - читайте упаковку)
желтые стержни - бумага, картон,дерево (или опять таки, подкрашенный универсал)
черные стержни (бывают серые) - резина, кожа, а так же для изоляции и герметизации швов